吴剑告诉我们，刑天死后，黄帝担心女娲族日后复仇，于是唆使九天玄女，继续追杀女娲族的子民。不过让黄帝没料到的是，九天玄女这次却拒绝了他，原因很简单，因为她在这次事件中已经知晓，黄帝并不是名正言顺的有熊国国王，而是一个反王。
九天玄女对于黄帝的阴险感到可耻，于是一气之下，帅人返回了西王母国，并把黄帝的阴谋告诉了西王母。西王母知道事情的始末后，才知道自己是在助纣为虐，盛怒之下，从此与黄帝一方断绝来往。
至于西王母国最后怎么样了，为什么会在几千年前突然消失，古籍中就再也没有了记载，因为女娲族的所有族人，已经将西王母国的人当做了不共戴天的仇人，两方再无来往。
黄帝称王的野心已经达到，对于西王母国的态度，他并没有放在心上，更为重要的是，他已经将九天玄女带来的《天篆文册龙甲神章》暗中抄录了一份，有了这个凭仗，黄帝觉得西王母国对于自己，已经是可有可无。
九天玄女走后没多久，黄帝命他的军师风伯把龙甲神章演绎成兵法十三章，孤虚法十二章，奇门遁甲一千零八十局。不仅如此，黄帝还根据龙甲神章上的记载，制造出许多厉害的武器和战车。後来经过周朝姜太公，黄石老人，再传给张良，张良把它精简之后变成现在我们看到的《奇门遁甲》。当然，这只是后话，我们日后再细说。
刑天的尸体一天没找到，黄帝就一日不得安心，于是他派人继续征讨女娲族。有了那些犀利的武器和战车，女娲族根本不是黄帝的对手，于是往大山深处逃亡，最后在黑竹沟那块儿躲藏了下来，并把刑天的尸体秘密的葬在了黑竹沟中的拇指峰中。
黑竹沟山势险峻，其中凶禽猛兽非常之多，加上又有致命的瘴气存在，黄帝大军进去后，就受到了重创，于是立即撤退，守在了黑竹沟外，于是，局面就暂时僵持了下来。
人类就是那样的自私，在面对共同的敌人时，便会拧作一团，一起抵抗，不过等暂时的危机解除了之后，又开始为自己的个人利益做打算，女娲族的那八十个长老就是如此。
国不可一日无君，族不可一日无长，为了女娲族新任族长的问题，八十一个长老各持不同的意见，最后发生了争执，内部矛盾就此开始。
在经过几次小规模的内斗之后，八十一个长老的意见仍然没有得到统一，于是大家一致决定，自己管理自己所带领的那部分族人，以后各自发展。
就这样，在黑竹沟中度过了三年时间之后，女娲族就此分崩离析，八十一个长老分别依据自己的姓名，成立了新的部族，最后分别离开了黑竹沟。
当时还有一部分族人不愿离开，他们选择跟随在巫医和巫师的身边，一起留在了黑竹沟发展。在这期间，黄帝派来的军队也试图闯进黑竹沟，但每一次都以失败而告终，因为进到黑竹沟内部的那些兵士，再也没有出来过，就好像他们被那险峻的山川给吞噬掉了一般。
除了蚩尤的残部之外，黄帝当时几乎平定了整个中原大地，他知道黑竹沟的事情后，或许是觉得刑天就算复活，也威胁不了自己的今日的地位，又或许是忌惮黑竹沟内部的凶险，不愿再浪费兵士们的性命，于是，他把驻守在黑竹沟外的那些军队给撤了回去。
过了几年的安定生活，留在黑竹沟内的那小部分女娲族人已经渐渐强大起来，这时候巫师提议，回到原来的栖息地去，毕竟那里才是他们真正的家。
巫医虽然也很想回到原栖息地去，可是看着如今的族人都过着非常安定的生活，他不免有些犹豫了。更重要的原因是，巫医通过种种蛊术的研究，发现假以时日，他可以利用一种尸虫，将刑天复活过来，这才是他不愿离开的最终原因。
巫师对于族长刑天也是十分的崇拜，也正是这个原因，他才没有跟随八十一个长老而去，所以他并没有反对巫医选择留在这里，而是自己带上一部分族人离开。在走之前，巫师把女娲族的神器天石留给了巫医，并表示自己以后会常来这边，也欢迎巫医带领族人随时归来。
巫师带领族人回到湘西以后，发现原栖息地被黄帝的大军肆掠过，以防被黄帝大军再次报复，于是他带走了一些有价值的东西，将族人的迁往了更深的大山之中，并成立的巫族，族人的姓氏一律改为吴姓。
巫族成立后没多久，便有不速之客找上门来，这些人都是当日女娲族那八十一个长老派来的人，如今他们都自立部族，散落在天下四处。
这些人来找巫师的原因很简单，是为了女娲族的神器天石。巫师自然不会让这些人的阴谋得逞，于是谎称天石已经被黄帝大军抢去，而正是因为这个原因，他们才放弃了古老的原栖息地。
长老们派来的人虽然不太相信，但忌惮巫师以前在族中的威信很高，又擅长各种巫术，于是只好就此作罢。
此后，巫师得到消息，为了得到族中的神器天石，八十一个长老曾经联合在一起，加上蚩尤的残部，与黄帝发生过大战，不过最终以失败而告终，还因此死了二十几个长老。
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